Overview 本篇我们来记录一下怎么使用TensorFlow2.0当中的Keras模块来进行CNN图片分类。 1.加载数据 我们用经典的猫狗分类数据集来做这次图片分类。 import os import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import tensorflow as tf from tensorflow.keras.m...阅读全文>>

Overview 我们团队完整的机器学习项目已经做了两个了，分别是Bastion4和Bastion6。之前两个项目上线部署的记录过于片段化，针对现在马上要做完的Bastion3项目，我们在此完整记录搭建服务器各种环境的全部流程，以备不时之需。 完整的项目基本分为三大部分：Java处理业务逻辑；Perl后台消息队列；R机器学习模型预测。每个大部分还有很多细节，我们会在每部分都详细记录。 新申...阅读全文>>

Overview 在做实验的时候因为要用到随机森林，所以使用了R中的randomForest包，但在画图的时候报了一个非常诡异的错误。 1. 错误描述 下面是我引入randomForest包之后的代码，这里省略了一些细节，只保留跟错误有关的代码: ## randomforest library("randomForest") # randomfo...阅读全文>>

蛋白质序列处理程序之前得到的数据源太乱，这些天整理并重新摆放了一下，每一步的输入文件夹后缀都有一个-in，处理程序文件夹后缀为-run，输出文件夹后缀为-out，这样条理清晰了很多，今日记录，以方便日后查阅使用。 数据处理部分共分5步： 下载并分类(set class) 多步CD-hit 正负样本1:1平衡(Dataset balance) 特征计算(feature calculation...阅读全文>>

该步骤为数据处理的第(4)步，共包含6小步。 其中前三步： 1. AAC,Amino acid composition(AminoAcidC.py) 2. SEQ,Sequence(Seq.py) 3. eft3,amino acids combination properties(involving kmp algorithm)(Eft3.py) 这前三步用到feature_calc.s...阅读全文>>

Overview Weka is easy to use when we do feature selection and classification. Using Weka's friendly graphic user interface, we can try and validate multiple feature selection methods and classifie...阅读全文>>

Overview 因为最近需要用到一些机器学习算法，Python的scikit-learn提供很多机器学习算法实现，可以很方便地用来做实验。今天在自己的电脑上安装了scikit-learn，并在此记录了安装的步骤。 安装pip 由于scikit-learn官方给的步骤是使用pip安装，所以要先安装pip。我是用了pip官方提供的安装页面 但是没有成功。因此想使用homebrew安装pip。使...阅读全文>>