Overview 之前项目的人遗留的数据散落在多种数据库中，既有MySQL，MongoDB，也有Cassandra和PostgreSQL。在Python3版本的jupyter中连接PostgreSQL需要安装psycopg2，而psycopg2在Python2中则是已经集成好的。 1. 安装python3-psycopg2和libpq-dev 先在Linux上安装好这两个包， sudo a...阅读全文>>

Overview 之前安装过很多次的phpMyAdmin，但最近一次安装时，出现了一个之前从来没遇到的问题：访问phpMyAdmin时，主页的php页面会被不能被解析成网页，而是直接显示了页面代码。 问题描述 文字描述已经比较清楚了，就不截图了。如果想看截图，参考 phpmyadmin showing php script [duplicate]。 对比之前的安装流程，发现这次安装Apac...阅读全文>>

Overview 今天在服务器（Ubuntu 16.04）使用pip安装深度学习包Keras的时候，发现安装结束之后下面有一行提示小字，大约就是pip有新版本可以更新，使用XXX命令更新，就顺带更新了一下，更新完了pip就不能用了... 问题描述 及时是查看下pip的版本 sudo pip --version 也会报下面的错误： Traceback (most recent call l...阅读全文>>

Overview 到目前为止，我们手里已经有了10台服务器了。之前一直说要把这些服务器搭建一个分布式文件系统，现在条件终于成熟了。这些服务器预装的系统大多数是Ubuntu16.04LTS发行版的Linux，少部分是Ubuntu14.04LTS。这次我们选择5台服务器，1台feagen(118.138.241.39)服务器作为tracker，4台服务器(Bastion3(118.138.24...阅读全文>>

Overview 前几天忽然收到学校云服务器安全中心的邮件，说我们部署的几台服务器流量明显出现异常，可能是被攻击了，并提供了几个可能的问题。大致看了下，问题出在Strut2，这不是个特有的问题，而是涉及到多个版本的安全问题，所以在这里记录一下。 问题描述 Struts2存在远程代码执行的严重漏洞，目前Struts2官方已经确认漏洞（漏洞编号S2-045，CVE编号：cve-2017-56...阅读全文>>

Overview Bastion4这个项目经过我们实验验证和安全考虑，决定舍弃kafka而转用gearman这个消息队列框架，具体分析将在后续文章中给出，这里只记录gearman相关的安装。 1.下载安装gearman 最新版的gearman是gearmand-1.1.12。我们执行下面几步，先将其下载到本地主文件夹，并解压缩。 sudo apt-get update wget https...阅读全文>>

Overview 这次我们开发Bastion4服务器使用了JAVA+Perl的架构，后端用Perl做服务器提供Webservice，用JAVA框架Struts接收处理用户请求，再跟Perl服务器交互。 我们使用Apache2作为Perl服务器，由于Apache2默认并不支持Perl，因此需要简单配置一下，使得Apache2以CGI的方式支持Perl运行。在配置的过程中，参考了一些网页，但由...阅读全文>>

Overview 前些天用ssh通过命令行登录我们的bastion4服务器还一切正常，到了昨天已经不能使用，但是用了相同的密钥的FileZilla依然可以登录，这就很奇怪了。 1.问题所在 用FileZilla登录到远程服务器，找到ubuntu用户下面的.ssh文件夹，打开之后可以看到只有一个文件authorized_keys，我把它下载下来。完成之后，我到本机的/home/young/D...阅读全文>>

Overview 这次的服务器，我们准备使用消息队列和SQLite这两个新东西，SQLite主要负责将用户提交的序列信息存储，并在结果页面查询显示。存储的信息包括用户的ip+timeStamp，序列内容，序列的处理状态。 1.安装SQLite SQLite的安装特别简单。 ubuntu14.04这个版本自带SQLite，在命令行输入sqlite3，显示如下： ～sqlite3 SQLite...阅读全文>>

Overview 因为投稿论文的需要，我们要把PhosphoPrediction部署到Monash的云服务器(Ubuntu 14.04.3 LTS (GNU/Linux 3.13.0-74-generic x86_64))上，在宋老师申请了云服务器之后，Jerico帮忙搭建好了云服务器，帮我们装好了JDK1.8，并给了我访问权限，在部署的过程中遇到了一些问题，在这里记录一下。 1. ssh...阅读全文>>