Overview 之前安装过很多次的phpMyAdmin，但最近一次安装时，出现了一个之前从来没遇到的问题：访问phpMyAdmin时，主页的php页面会被不能被解析成网页，而是直接显示了页面代码。 问题描述 文字描述已经比较清楚了，就不截图了。如果想看截图，参考 phpmyadmin showing php script [duplicate]。 对比之前的安装流程，发现这次安装Apac...阅读全文>>

Overview 因为想尝试一些深度学习模型，就用Keras开始建模（为什么使用Keras？）。而且由于之前使用的极其模型都是基于R语言的，所以我们依然尝试使用R语言版本的Keras来训练深度学习模型。 Keras的R语言接口 Keras本身就是一个基于Tensorflow、Theano以及CNTK编写的纯Python框架，因为方便易用，所以使用广泛，为了让R语言开发者也能在R中使用Ke...阅读全文>>

Overview 今天在服务器（Ubuntu 16.04）使用pip安装深度学习包Keras的时候，发现安装结束之后下面有一行提示小字，大约就是pip有新版本可以更新，使用XXX命令更新，就顺带更新了一下，更新完了pip就不能用了... 问题描述 及时是查看下pip的版本 sudo pip --version 也会报下面的错误： Traceback (most recent call l...阅读全文>>

Overview 今天在Mac上运行一个在Windows中处理过的R脚本，不能正常运行，错误信息指向明确。 问题描述 使用./H_gr500_tune.R运行，报下面的错误： env: Rscript\r: No such file or directory 打开这个脚本，头几行内容如下： #!/usr/bin/env Rscript library(e1071) library(ply...阅读全文>>

Overview 最近在一台新的电脑上运行一个R脚本时，报了一个很奇怪的错误。因为类似的脚本已经运行了很多次，所以很快就可以确定是电脑的R环境不兼容引起的问题。 问题描述 脚本在运行时需要载入caret包，结果载入过程中报下面的错误： Loading required package: gplots Attaching package: ‘gplots’ The following o...阅读全文>>

Overview 前几天忽然收到学校云服务器安全中心的邮件，说我们部署的几台服务器流量明显出现异常，可能是被攻击了，并提供了几个可能的问题。大致看了下，问题出在Strut2，这不是个特有的问题，而是涉及到多个版本的安全问题，所以在这里记录一下。 问题描述 Struts2存在远程代码执行的严重漏洞，目前Struts2官方已经确认漏洞（漏洞编号S2-045，CVE编号：cve-2017-56...阅读全文>>

Overview 最近把系统更新到了最新版本(10.12.3)，又安装了一个新的语言Julia，再使用R的时候，发现命令行已经不能通过R命令进入了，连*.R文件都不再能被R语言关联了。具体原因未知，于是先下了一个最新的R-3.3.3，顺带删了Julia，所有的library都要重新安装，结果安装好xlsx后导入的时候报了错。 各种解决方法都尝试了，还是不行。考虑到可能是R的版本太新了，就把...阅读全文>>

Overview 这次我们开发Bastion4服务器使用了JAVA+Perl的架构，后端用Perl做服务器提供Webservice，用JAVA框架Struts接收处理用户请求，再跟Perl服务器交互。 我们使用Apache2作为Perl服务器，由于Apache2默认并不支持Perl，因此需要简单配置一下，使得Apache2以CGI的方式支持Perl运行。在配置的过程中，参考了一些网页，但由...阅读全文>>

Overview 虽然已经用了很久的R语言，但一直没整理过，正好需要在我们的云服务器上安装R，所以一并记录下来了。下面的过程虽然是在Ubuntu 14.04上安装的，但是对于其他版本的系统，R和R packages的安装都大同小异。 1. 安装R 1.1 添加源 Ubuntu 14.04中的R版本比较旧，默认安装可能会出很多问题(我试过了)。所以最好添加一个新的源。 在etc/apt/so...阅读全文>>

Overview 一直想把常用的命令搜集起来，以便平时用到的时候查阅，可惜一直没抽出来时间专门整理下。最近在做序列的特征提取和多个特征文件合并时，频繁使用到了一些命令，干脆一并整理到这里，以后边用边添加整理新的命令。 这里的linux命令主要在MAC 10.9.5和Ubuntu 14.04下测试，涉及到平台差异性的时候，会尽量指出来，没有区分的话就表示两种平台下都可以使用。如果仍有没涉及到...阅读全文>>