Overview

因为想尝试一些深度学习模型,就用Keras开始建模(为什么使用Keras?)。而且由于之前使用的极其模型都是基于R语言的,所以我们依然尝试使用R语言版本的Keras来训练深度学习模型。

KerasR语言接口

Keras本身就是一个基于TensorflowTheano以及CNTK编写的纯Python框架,因为方便易用,所以使用广泛,为了让R语言开发者也能在R中使用KerasTaylor Arnold写了kerasR包,而RStudio公司开发了keras包,关于这两个包的区别,参见keras: Deep Learning in R

这里我使用kerasR包为例,在Ubuntu 16.04的R中安装Keras,并提供一些链接进一步学习使用kerasRKeras

安装过程

安装pip

pip是一个很方面易用的Python包管理工具,使用pip``可以很方便地安装TensorflowKeras`。
使用下面的命令安装:

sudo apt-get install python-pip

默认你已经安装了Python,如果没装Python,使用下面的命令一起装了:

sudo apt-get install python-pip python-dev build-essential 

安装之后查看pip的版本信息:

pip -V

想要升级pip

sudo pip install --upgrade pip 

注意:装了最新版本的pip(或者是升级到最新版本的pip),可能会报错,参考Python包管理软件pip更新后报错

安装Tensorflow

因为Keras本身是Tensorflow运行的机器学习框架,所以安装Keras之前先安装Tensorflow

sudo pip install tensorflow

这里我是用了系统权限sudo,如果没有系统权限,也可以不用。
如果想安装指定版本的Tensorflow,可以用下面的命令安装:

sudo pip install tensorflow==1.2.1

如果想安装GPU版本的Tensorflow,可以用下面的命令安装:

sudo pip install tensorflow-gpu

在安装Tensorflow的过程中可能会报类似于下面的错误:

Cannot uninstall 'enum34'. It is a distutils installed project and thus we cannot accurately determine which files belong to it which would lead to only a partial uninstall.

这是因为安装Tensorflow需要安装enum34,在安装enum34时需要删除旧的enum34。而在删除旧的enum34时,版本依赖多,不能系统清晰的删除。所以需要手动安装enum34并忽略已经安装的版本:

sudo pip install nibabel --ignore-installed nibabel

然后重新安装Tensorflow就可以了。

安装Keras

sudo pip install keras

安装成功后,打开python命令行,导入一下Tensorflow

>>> import keras as kr
Using TensorFlow backend.

说明Keras已经装好。

安装kerasR

先打开R语言命令行(最后使用sudo,这样可以将R包安装到系统目录):

sudo R

安装kerasR

install.packages("kerasR")

安装成功后,导入kerasR,并检查状态:

library("kerasR")
keras_init()

如果不报错,就说明安装成功。

如果报了类似于下面的错误:

>> keras not available
>> See reticulate::use_python() to set python path, 
>> then use kerasR::keras_init() to retry

就说明要么是KerasTensorflow没装好,要么是R找不到Python的路径。一般来说Python装在系统路径中,不会找不到。以防万一,可以查看下自己的Python路径,手动使用reticulate::use_python()函数加进去。比如在Ubuntu下面,一般是在/usr/bin/python,那就可以用下面的命令安装:

reticulate::use_python("/usr/bin/python")

使用kerasR

安装好之后,可以参考下面的链接来在真实数据集上运行几个例子:

因为kerasR只是Keras的一个R语言接口,所以使用kerasR之前还是要对Keras有一些了解。可以查看下面的链接快速了解Keras

如果想快速上手一些Keras模型,可以查看下面的链接:

参考文献