Overview 最近需要用到数个Python程序处理蛋白质序列以输出特征值，而这些Python文件需要在Shell脚本中传入文本文件（该文本文件记录了某些蛋白质序列）做参数，进而依次被Shell调用。我们在Java程序中建立Shell脚本的运行时环境Runtime，这其中用到了一个类，即java.lang.Runtime，下面对该类进行探讨和记录。 1.直接运行Shell命令 java....阅读全文>>

Overview Weka is easy to use when we do feature selection and classification. Using Weka's friendly graphic user interface, we can try and validate multiple feature selection methods and classifie...阅读全文>>

Overview 第一个项目中，输入框内的sequence传入后台，并在Action中用String类型的seq接收，继而处理成txt文件形式保存。由于以后的项目均要频繁使用io以及这种中间处理方式，故在参考了前人的类似处理方法之后，提取出适合本项目的Java类FileTimeStamp。 该Java类负责以“sequence_input_时间戳”的形式命名文本文件。以下便是该处理类的代码...阅读全文>>

Overview 最近经常需要使用到Perl处理文件，因此在此记录一下经常使用到的Perl知识。 1. Perl脚本中接受命令行参数 很多时候我们编写一个Perl脚本，都是用来处理一个文件，输出为另一个文件，例如，脚本file_converter.pl将input.txt中的格式处理之后转化为另一种格式存储在output.txt中，则通常我们的使用习惯是 ./file_converter.p...阅读全文>>